文章摘要:(背景)多杀性巴氏杆菌（Pasteurella multocida，Pm）是一种常见致病菌，可以引起多种禽类、家畜、野生动物，甚至人类的感染。本实验室先前从患病海南黑山羊组织中分离出一株D型Pm。（目的）为进一步了解该菌株的基因组特征，明确其毒力相关基因和遗传进化关系。为Pm感染疾病的预防和临床治疗提供参考。（方法）将该菌株命名为“Pm HN01”株，使用SMRT技术和Illumina测序技术相结合的方法进行全基因组测序。使用生物信息学、PCR鉴定和系统进化树等方法对Pm HN01株的基因组特征、毒力相关基因和遗传进化关系进行分析。（结果）将测序后的基因组信息提交至NCBI，获得登录号CP037861。Pm HN01株与其他巴氏杆菌具有相似的基因组谱，大小为2349898 bp，GC含量为40.25%，预测到2401个编码基因。在GO、KEGG和COG分析中分别有1651、2227和1912个基因注释。在PHI、VFDB和T3SS分析中，分别有121个、43个和84个基因注释。此外，选取23个毒力基因引物对其进行PCR鉴定，结果发现Pm HN01株含有exbB、exbD、tbpA、toxA、fimA等12个毒力基因，同北京和新疆等国内菌株的进化关系最近，同美国、瑞士、丹麦等国外菌株的进化关系最远。（结论）本研究首次获得了山羊源D型Pm HN01株的完整基因组信息，为Pm的基因组数据库增添了材料，丰富了Pm的宿主类型。进一步完善了Pm HN01株的毒力基因和系统进化信息，为后续Pm的流行区域和致病性研究提供了理论参考。

文章关键词:

项目基金:文章来源：《中国病原生物学杂志》 网址: http://www.zgbyswxzz.cn/qikandaodu/2021/1129/979.html