文章摘要:目的 通过基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analaysis,WGCNA）及蛋白质相互作用（proteinprotein interaction,PPI）识别肺腺癌发生发展中的枢纽基因。方法 从TCGA数据库中下载497例肺腺癌组织和54例正常肺组织的RNA-seq表达矩阵及配套临床信息。利用R语言的DESeq2软件包进行差异基因表达分析。随后通过WGCNA筛选出枢纽模块，PPI分析鉴定出枢纽基因。最后使用GEIPA数据库验证枢纽基因与肿瘤分期、预后的关系。结果 通过DESeq2分析得到1 904个差异基因。通过构建共表达网络，确定棕色和蓝色模块为枢纽模块，PPI分析筛选得到核分裂周期蛋白80（nuclear division cycle 80,NDC80）为枢纽基因。GEIPA数据库验证结果显示NDC80基因与肿瘤的分期相关（F=3.58,P<0.05），且NDC80基因高表达与肿瘤的总生存期较差有明显相关（HR=1.6,P<0.05）。结论 通过构建WGCNA及PPI分析得到枢纽基因NDC80，且NDC80基因的高表达与肿瘤的分期及预后密切相关。提示NDC80基因有望成为肺腺癌预后的生物学标志物。

文章关键词:

论文分类号:R734.2

文章来源：《中国病原生物学杂志》 网址: http://www.zgbyswxzz.cn/qikandaodu/2022/0119/1083.html